Syno?人類全基因組CRISPR敲除文庫(Human Genome CRISPR Knockout Libraries)

CRISPR技術作為繼ZFN和TALEN之后第三代基因編輯技術,具有高效、快速、精準等特點,廣泛應用于基因功能研究、藥物開發、作物育種、分子診斷、精準醫療等領域。利用CRISPR 文庫進行基因組功能篩選一直是當下熱門的研究手段,被全球知名期刊爭相報道。

CRISPR文庫雖然是進行科學研究的強大工具,但是由于其后期篩選工作量大、成本消耗高,也成為了其普遍應用的阻礙。泓迅科技專注于CRISPR基因編輯技術的研究工作,不斷提升服務和產品的供應能力,在定制化CRISPR文庫構建的基礎上,推出Syno?人類全基因組CRISPR敲除文庫,領先的設計和規范化的文庫構建實現高質量交付,降低客戶的研究成本,縮短產品交付周期。

Syno?人類全基因組CRISPR敲除文庫根據Genome CRISPR數據庫中記錄的以前發表的CRISPR篩選中的表型以高靶向活性和低脫靶效率為準則,結合多種不同的設計原則,選擇評分較高的sgRNA序列。根據近期發表的評分規則,Syno? CRISPR文庫的評分要優于GeCKOv2文庫和隨機挑選的已發表sgRNA樣本。

Syno? 人類全基因組CRISPR敲除文庫由三個獨立子庫A、B、C組成,A和B文庫分別針對18,913和18,334個蛋白質編碼基因。子庫A包含根據設計標準排名最好的sgRNA,在較低的文庫覆蓋率下實現高質量的篩選。子庫B包含第二層sgRNA,當需要更高的sgRNA覆蓋率時,可以用來補充子庫A。子庫C是通過整合大規模CRISPR篩選的標準化資源,以及多個效率指標,對廣泛采用的CRISPR文庫中的300,000多個特有的sgRNA進行評估和排序,設計出了一個優化的人類最小全基因組敲除文庫,針對18,761個基因,每個基因設計2個優化的sgRNA,合計有37,522個基因靶向和200個非靶向sgRNA。子庫C的大小比目前公開的人類全基因組CRISPR文庫均小。雖然子庫C較小但是并不影響對必須基因的識別,多用于復雜條件下癌癥細胞模型的CRISPR篩選。

文庫產品優勢

  1. 精準的sgRNA設計:利用有效的sgRNA設計模型結合深度學習算法,設計出具有高靶向活性和低脫靶率的sgRNA序列。
    sgRNA library design
  2. 優化的載體:采用lentiCRISPRv2載體,具備Puro藥篩功能,可進行慢病毒包裝,提高轉染效率。
    virus-vector
  3. 節約成本:高編輯效率CRISPR文庫,減輕后期篩選工作的難度,降低研究成本。
    sgRNA library synthesis
  4. 一站式服務:提供NGS驗證、病毒包裝、生信分析等定制化的服務。
    CRISPR-one-stop-service
  5. 嚴格質控:構建的文庫覆蓋率>99.9%,均一性<10。
  6. 交付周期短:質粒文庫次日發貨。

文庫產品詳情

產品編號 產品名稱 序列信息 載體信息 價格(元) 規格
STCRI211101 Syno?人類全基因組CRISPR敲除文庫(Human Genome CRISPR Knockout Libraries) 子庫A:
靶向18,913個基因,設計74,552個sgRNA序列和435個對照(非靶向)sgRNA序列,合計74,987個sgRNA序列。
lentiCRISPR v2
(帶Puro篩選標記)
咨詢 200μg
STCRI211102 子庫B:
靶向18,334個基因,設計71,048個sgRNA序列和435個對照(非靶向)sgRNA序列,合計71,483個sgRNA序列。
lentiCRISPR v2
(帶Puro篩選標記)
咨詢 200μg
STCRI211103 子庫C:
靶向18,761個基因,設計37,522個sgRNA序列和200個對照(非靶向)sgRNA序列,合計37,722個sgRNA序列。
lentiCRISPR v2
(帶Puro篩選標記)
咨詢 200μg

*更多服務信息,請咨詢support@synbio-tech.com。

相關服務

sgRNA定制化設計
sgRNA文庫構建
ssDNA合成
微生物基因組編輯
哺乳動物基因組編輯
sgRNA生物信息分析

參考資料
[1] Luisa Henkel, Benedikt Rauscher, Barbara Schmitt, et al. Genome-scale CRISPR screening at high sensitivity with an empirically designed sgRNA library. BMC Biol. 2020; 18: 174.
[2]Emanuel Gon?alves, Mark Thomas, Fiona M. Behan, et al. Minimal genome-wide human CRISPR-Cas9 library. Genome Biol. 2021; 22: 40.